Очолює Київську духовну академію і семінарію ректор — Преосвященніший єпископ Білогородський Сильвестр, вікарій Київської Митрополії, ректор Київської духовної академії і семінарії, професор.

 

Ректор Київських духовних шкіл призначається на посаду указом Блаженнішого Митрополита Київського і всієї України на підставі рішення Священного Синоду Української Православної Церкви.

 

Ректор здійснює керівництво Київською духовною академією та семінарією відповідно до академічного Статуту, при посередництві заступників (проректорів), котрі затверджуються на посаді Блаженнішим Митрополитом Київським і всієї України. Ректором затверджується внутрішній розпорядок і регламент роботи, повноваження структурних підрозділів та посадові обов’язки працівників Київської духовної академії і семінарії, а також, в межах своєї компетенції, видаються накази, розпорядження, вказівки, обов’язкові для виконання працівниками Київської духовної академії.

 

Вчена рада — колегіальний орган, який здійснює загальне керівництво діяльністю Академії. До складу Вченої ради Академії за посадою входять: ректор, проректори, секретар Вченої ради, завідувачі кафедрами. Інші члени Вченої ради обираються Загальними зборами або призначаються ректором.

 

Проректори, секретар Вченої ради, старший помічник і штат чергових помічників проректора з виховної роботи складають адміністрацію Київських духовних шкіл.

 

Перший проректор — протоієрей Сергій Ющик, кандидат богослов’я, професор

 

Проректор з науково-богословської роботи — Бурега Володимир Вікторович, кандидат богослов’я, кандидат історичних наук, професор.

 

Проректор з виховної роботи — архімандрит Амвросій (Вайнагій), кандидат богослов’я, доцент.

 

Проректор з навчально-методичної роботи — ієромонах Філарет (Волошин), кандидат богослов’я.

 

Секретар Вченої ради — протоієрей Василій Яковчук, кандидат богослов’я, доцент.

 

Завідуючий Сектором заочного навчання — архімандрит Маркел (Павук), кандидат богослов’я, доцент.

 

Ректором призначаються також:

 

Помічник ректора по роботі з іноземними студентами — протоієрей Ростислав Снігірьов, доктор богослов’я, професор.

 

Духівник Київських духовних шкіл — архімандрит Маркел (Павук), кандидат богослов’я, доцент.

 

Благочинний академічного храму Різдва Пресвятої Богородиці — архімандрит Досифей (Михайлюк).

 

Завідуючий бібліотекою КДАіС та Церковно-археологічним музеєм — архімандрит Дамаскін (Лебедь), кандидат богослов’я.

 

Редактор сайту КДАіС — Надь Олег Оттович, кандидат богослов’я.

 

Економ — архімандрит Іларіон (Кострець), кандидат богослов’я.